ISCC认证对于废弃物和残渣，ISCC认证对可追溯性做了重点要求，废弃物和残渣必须能追溯到其产生点，ISCC定义为原始收集点（pointoforigin），追溯系统必须覆盖整条供应链。原始收集点须签署满足ISCC要求的自我声明。追溯可通过物料平衡、分离、识别码和交付单据等手段实现，确保原产国、原料类型、名称、数量和温室气体排放数值在供应链的各个节点清晰可辨。
ISCC认证开发了其监测和评估系统，以生成关于ISCC系统的总体影响的信息。ISCC想要实现的目标在变化理论中被表述出来了，这就是为什么它的持续评估是必要的，以跟踪ISCC的愿景和提高ISCC的影响测量的质量。
ISCC的影响评估主要基于来自内部数据库的数据，其中包括来自证书、培训会议和利益相关者事件的数据，以及来自APS提供的认证审计的数据（见信息框）。通过ISCC向其合作认证机构发送的一项调查收集了其他定性数据。
ISCC的认证流程如下文所示:
1)选择合适的认证体系和一家具备ISCC资质的认证机构(CB)，并签订认证服务合同;
2)在ISCC网站下载最新的ISCC注册表并填写完整，然后发送到ISCC邮箱进行注册，
3)根据ISCC要求准备审核材料,并组织内部人员进行内部审核，完成内部审核报告。准备的材料包括但不限于管理文件、物料平衡记录台账、温室气体计算表等，
4)认证机构对企业进行外部审核并提出审核意见，企业必须在40天内根据审核意见完成整改;
5)整改完成后认证机构完成审核报告,并签发ISCC证书;.
6)认证机构提交所有关于证书的必要信息给ISCC,ISCC在网站上公布证书信息。
